Abbiamo un alta considerazione di personaggi come Darwin da fare giustamente domande come la tua...
Il problema è che , dal poco che ho letto: 1)C'è poca farina del suo sacco nella sua teoria. 2) Era, a livello caratteriale molto confuso, combatutto e insicuro. 3)Non aveva, contrariamente (appunto) a quanto potremo pensare, una mente brillante ne rigorosa.
Vedi qui

Quindi se Darwin aveva una risposta alle domande che hai posto, la risposta probabilmente sarebbe stata la non-risposta per eccellenza: il caso.